MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 109952

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009525	TCAGG	2	10	63808	63817	20 %	20 %	40 %	20 %	148659818
1502	NC_009525	GGC	2	6	63856	63861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659818
1503	NC_009525	TGC	2	6	63870	63875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659818
1504	NC_009525	GC	3	6	63915	63920	0 %	0 %	50 %	50 %	148659818
1505	NC_009525	A	6	6	63923	63928	100 %	0 %	0 %	0 %	148659818
1506	NC_009525	GAT	2	6	63967	63972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659818
1507	NC_009525	CGA	2	6	63993	63998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659818
1508	NC_009525	CG	3	6	64034	64039	0 %	0 %	50 %	50 %	148659818
1509	NC_009525	CGT	2	6	64102	64107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659818
1510	NC_009525	CA	4	8	64159	64166	50 %	0 %	0 %	50 %	148659818
1511	NC_009525	TCG	2	6	64170	64175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659818
1512	NC_009525	CTG	2	6	64229	64234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659818
1513	NC_009525	CGA	2	6	64258	64263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659818
1514	NC_009525	CGA	2	6	64314	64319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659818
1515	NC_009525	TG	3	6	64387	64392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_009525	ATG	2	6	64424	64429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_009525	CGG	2	6	64462	64467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_009525	CGT	2	6	64491	64496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_009525	GGT	2	6	64603	64608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659819
1520	NC_009525	ATC	2	6	64675	64680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659819
1521	NC_009525	CTG	2	6	64693	64698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659819
1522	NC_009525	CAG	2	6	64706	64711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659819
1523	NC_009525	CGA	2	6	64718	64723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659819
1524	NC_009525	GCC	2	6	64757	64762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659819
1525	NC_009525	GTC	2	6	64768	64773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659819
1526	NC_009525	CAG	2	6	64782	64787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659819
1527	NC_009525	GCG	2	6	64831	64836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659819
1528	NC_009525	CGT	2	6	64854	64859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659819
1529	NC_009525	CGG	2	6	64884	64889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659819
1530	NC_009525	CAT	2	6	64929	64934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659819
1531	NC_009525	GTG	2	6	64950	64955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659819
1532	NC_009525	TGC	2	6	64971	64976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659819
1533	NC_009525	GCC	2	6	64997	65002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659819
1534	NC_009525	TCG	2	6	65024	65029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659819
1535	NC_009525	GAC	2	6	65071	65076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659819
1536	NC_009525	GCC	2	6	65090	65095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659819
1537	NC_009525	GCC	2	6	65098	65103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659819
1538	NC_009525	GT	3	6	65149	65154	0 %	50 %	50 %	0 %	148659819
1539	NC_009525	TCA	2	6	65225	65230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659819
1540	NC_009525	TAC	2	6	65242	65247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659819
1541	NC_009525	AAGG	2	8	65249	65256	50 %	0 %	50 %	0 %	148659819
1542	NC_009525	AGG	3	9	65254	65262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_009525	CCT	2	6	65290	65295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148659820
1544	NC_009525	CGC	2	6	65375	65380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659820
1545	NC_009525	TCG	3	9	65448	65456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659820
1546	NC_009525	CAT	2	6	65485	65490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659820
1547	NC_009525	CCA	2	6	65499	65504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659820
1548	NC_009525	CAG	2	6	65675	65680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659820
1549	NC_009525	C	6	6	65707	65712	0 %	0 %	0 %	100 %	148659820
1550	NC_009525	GC	3	6	65767	65772	0 %	0 %	50 %	50 %	148659820
1551	NC_009525	GCG	2	6	65791	65796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659820
1552	NC_009525	CAG	2	6	65804	65809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659820
1553	NC_009525	CGC	2	6	65810	65815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659820
1554	NC_009525	CCGATC	2	12	65892	65903	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148659820
1555	NC_009525	AACC	2	8	66026	66033	50 %	0 %	0 %	50 %	148659820
1556	NC_009525	ACT	2	6	66044	66049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659820
1557	NC_009525	GCT	2	6	66169	66174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659820
1558	NC_009525	CGA	2	6	66277	66282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659820
1559	NC_009525	TCG	2	6	66337	66342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_009525	GCT	2	6	66384	66389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659821
1561	NC_009525	CGGA	2	8	66390	66397	25 %	0 %	50 %	25 %	148659821
1562	NC_009525	ACC	2	6	66412	66417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659821
1563	NC_009525	GGC	2	6	66422	66427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659821
1564	NC_009525	CCG	2	6	66446	66451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659821
1565	NC_009525	ACTTCA	2	12	66696	66707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659821
1566	NC_009525	CGG	2	6	66738	66743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659821
1567	NC_009525	TGCCG	2	10	66839	66848	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1568	NC_009525	GCC	2	6	66891	66896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1569	NC_009525	GTC	2	6	66989	66994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659822
1570	NC_009525	ATT	2	6	67022	67027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148659822
1571	NC_009525	TCA	2	6	67042	67047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659822
1572	NC_009525	CG	3	6	67062	67067	0 %	0 %	50 %	50 %	148659822
1573	NC_009525	CCT	2	6	67080	67085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148659822
1574	NC_009525	CGG	2	6	67214	67219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659822
1575	NC_009525	CGC	2	6	67227	67232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659822
1576	NC_009525	GC	3	6	67231	67236	0 %	0 %	50 %	50 %	148659822
1577	NC_009525	CCG	2	6	67246	67251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659822
1578	NC_009525	CCG	2	6	67312	67317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659822
1579	NC_009525	CGG	2	6	67326	67331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659822
1580	NC_009525	GCG	2	6	67354	67359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659822
1581	NC_009525	GGC	2	6	67362	67367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659822
1582	NC_009525	CGA	2	6	67505	67510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659822
1583	NC_009525	TCG	2	6	67514	67519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659822
1584	NC_009525	GCTG	2	8	67655	67662	0 %	25 %	50 %	25 %	148659822
1585	NC_009525	GCC	2	6	67678	67683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659822
1586	NC_009525	CG	5	10	67708	67717	0 %	0 %	50 %	50 %	148659822
1587	NC_009525	ACC	2	6	67747	67752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659822
1588	NC_009525	GGCGA	2	10	67771	67780	20 %	0 %	60 %	20 %	148659822
1589	NC_009525	CAC	2	6	67902	67907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659822
1590	NC_009525	GC	3	6	67919	67924	0 %	0 %	50 %	50 %	148659822
1591	NC_009525	CGGA	2	8	67964	67971	25 %	0 %	50 %	25 %	148659822
1592	NC_009525	CGTCGG	2	12	68094	68105	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_009525	GGT	2	6	68179	68184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_009525	TGC	2	6	68217	68222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_009525	GCC	2	6	68320	68325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659823
1596	NC_009525	GCC	2	6	68335	68340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659823
1597	NC_009525	CTGG	2	8	68387	68394	0 %	25 %	50 %	25 %	148659823
1598	NC_009525	TTC	2	6	68403	68408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148659823
1599	NC_009525	GAC	2	6	68437	68442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659823
1600	NC_009525	CGG	2	6	68501	68506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659823
1601	NC_009525	AAC	2	6	68566	68571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148659823
1602	NC_009525	ACG	2	6	68675	68680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659823
1603	NC_009525	CCA	2	6	68681	68686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659823
1604	NC_009525	CGGG	2	8	68688	68695	0 %	0 %	75 %	25 %	148659823
1605	NC_009525	CGCC	2	8	68705	68712	0 %	0 %	25 %	75 %	148659823
1606	NC_009525	CGGC	2	8	68747	68754	0 %	0 %	50 %	50 %	148659823
1607	NC_009525	CGGT	2	8	68783	68790	0 %	25 %	50 %	25 %	148659823
1608	NC_009525	GCG	2	6	68810	68815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659823
1609	NC_009525	CGTCGG	2	12	68864	68875	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148659823
1610	NC_009525	TGC	2	6	68879	68884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659823
1611	NC_009525	ACC	2	6	68918	68923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659823
1612	NC_009525	GCGGTG	2	12	68945	68956	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148659823
1613	NC_009525	CGT	2	6	69018	69023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659823
1614	NC_009525	CCG	2	6	69089	69094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659823
1615	NC_009525	CCGG	2	8	69169	69176	0 %	0 %	50 %	50 %	148659823
1616	NC_009525	GGC	2	6	69181	69186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659823
1617	NC_009525	GGC	2	6	69192	69197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659823
1618	NC_009525	ACCG	2	8	69225	69232	25 %	0 %	25 %	50 %	148659823
1619	NC_009525	CGC	2	6	69302	69307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659823
1620	NC_009525	CGG	2	6	69318	69323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659823
1621	NC_009525	ACG	2	6	69337	69342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659823
1622	NC_009525	CGG	2	6	69374	69379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659823
1623	NC_009525	GC	3	6	69437	69442	0 %	0 %	50 %	50 %	148659823
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1625	NC_009525	CCG	2	6	69622	69627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659823
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